同じ国のなかでも複数のウイルス型が存在する
今回の研究では、前回のウイルスの進化系統樹の作成を目的とした学問的な視点とは少し異なり、ウイルスの型を迅速に判断するため、特定部位の遺伝子変化を集中的に調べる方法がとられました。
その結果、本手法においてはコロナウイルスに17の型が存在することが明らかになりました。
上の画像では、各国で検出されたそれぞれの型の割合を示しています。
緑～茶色系の色が東アジアでみられる型で、オレンジ～赤が主にヨーロッパでみられる型です。
日本ではこれまで中国の少数派閥から発した東アジア型が主流でしたが、3月11日以降はオレンジのヨーロッパ型の検出が増えてきました。
日本と同じヨーロッパ型の変異が確認された国は、イギリス・アイスランド・ベルギー・オランダ（ネーデルランド）・イタリア・ドイツ・ブラジル・カナダなどがあげられます。
これは東アジアからはじまった感染がヨーロッパを巡り、日本へUターンしてきたということでしょう。
初期において強い封鎖が行われていた中国などでは、このようなUターン現象はみられませんでした。
またアメリカでは、アメリカで独自に進化した青色の変異体が優勢な地域（ワシントン・アイダホ）がある一方で、爆発的な感染が起きているニューヨークでは、日本とは異なる別のヨーロッパ型（黄色に近いオレンジ）が優勢になっています。
同じコロナウイルスでも、地域によってかなり変異体のばらつきがあることがわかります。
日本でも、東京都それ以外の地域で流行している変異体には違いがあるのかもしれません。
また興味深いことに、上にグラフのように、感染の主流型が交代する現象も確認できました。
アメリカでは初期は東アジア型が優勢でしたが、時間と共に東アジア型が駆逐され、アメリカ独自型とヨーロッパ型が支配的な地位を占めるようになりました。
通常、このような比率の変動は、隔離措置などによる人為的な影響（選択圧）、もしくはウイルスどうしで競争が行われ、強いものが弱いものを駆逐した場合にみられます。
もしアメリカ型（青）やニューヨークの主流であるヨーロッパ型（黄色に近いオレンジ）に他とは異なる強い感染力がある場合、特に強い警戒を要する型になるでしょう。
